"Szczęśliwe" dzieciństwo
Kolejnym sukcesom filmowym towarzyszyły doniesienia o ekscesach młodego aktora, który od lat miał problemy z nadużywaniem alkoholu i kontrolowaniem agresji. Zachowanie to wyniósł z domu – choć LaBeouf często zapewniał, że miał szczęśliwe dzieciństwo, to metody wychowawcze jego ojca trudno uznać za przykład dobrego rodzicielstwa.
Jeffrey Craig LaBeouf, dziś 70-latek, jest weteranem wojny w Wietnamie. Razem z matką chłopaka wiedli hipisowskie życie, w którym nie brakowało alkoholu, narkotyków i przemocy. "Byli dziwną parą, ale kochali mnie, a ja kochałem ich" – zapewniał Shia, który jednocześnie ma w pamięci traumatyczne wspomnienia z udziałem ojca. Kiedyś Jeffrey celował do syna z pistoletu, bo myślał, że jest w Wietnamie.